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所在平台: Udemy |
课程主页: https://www.udemy.com/course/programacao-em-python-para-biologos/
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## Coursera 课程总结：Python 编程在生物学问题中的应用 本课程旨在为生物学家、生物学学生以及相关领域的专业人士提供 Python 编程入门。在数据量剧增和计算建模日益重要的背景下，编程技能对于生物学研究者来说至关重要，能够帮助他们开发应用于分子生物学、生态学、疾病研究等领域的应用程序。 **课程核心内容：** * **Python 基础：** 介绍 Python 的安装、开发环境（IDE）、变量、常量、字符串、算术运算、逻辑与关系运算符、条件语句、循环语句（for 和 while）、函数、数据结构（列表、字典、元组、集合、矩阵）等核心概念。 * **高级主题：** 涵盖文件操作、错误与异常处理、正则表达式以及面向对象编程的基础知识。 * **生物学应用：** 将所学 Python 知识应用于真实的生物学问题，通过案例研究和实践项目加深理解。 **实践项目示例：** * 根据氨基酸组成预测肽链质量。 * 开发生物学测验程序，计算得分和对错情况。 * 创建与生物学对象相关的类。 * 分析 FASTA 格式的基因序列。 * 根据 Hardy-Weinberg 定理分析基因频率。 * 创建用于种群生态学计算的函数。 * 发现 RNA 序列中的模式。 * 计算基因距离估计。 * 构建基础物种鉴定键。 * 解决基因频率问题。 * 创建分析 PDB 格式蛋白质序列文件的脚本。 * DNA 序列到 RNA 的转录。 **课程结构：** 课程包含超过 90 节视频课程，涵盖概念讲解、代码演示和练习题。此外，还提供超过 30 个具有挑战性的练习，将所学概念应用于生物学场景，并附有详细的视频解答。学员还将参与 4 个小型项目，整合所学大部分知识来解决更复杂的问题。 **目标学员：** 生物学、生物医学、生态学、药学及其相关领域的学生和专业人士，尤其是那些对编程缺乏经验但希望利用计算工具解决生物学问题的群体。
Biólogos, estudantes de biologia e profissionais de áreas afins têm geralmente pouco ou nenhum contato com programação, que é em geral associada com a áreas de tecnologia da informação. Entretanto, a crescente quantidade de dados em bancos de dados genômicos, de proteínas e de organismos; somado ao papel cada vez maior que a modelagem computacional possui na descoberta de drogas, inseticidas e outros, faz com que biólogos se beneficiem do conhecimento de programação para que possam desenvolver aplicações que terão cada vez mais espaço na biologia molecular, ecologia, pesquisas sobre doenças, entre outras.Baseado nisso, este curso foi desenvolvido com a finalidade de introduzir aos biólogos, estudantes de biologia, biomedicina, ecologia, farmácia e profissionais de áreas afins a programação utilizando a linguagem Python, que é uma das linguagens de programação mais utilizadas no mundo atualmente. Ela possui uma sintaxe clara e é considerada de fácil aprendizagem, principalmente para profissionais que não são da área da tecnologia. Além disso, muitas ferramentas usadas no âmbito da biologia foram escritas com a linguagem Python, o que faz dela uma ótima opção para estabelecer o primeiro contato com programação. Neste curso você aprenderá as principais estruturas do Python, como por exemplo:Instalação do Python e principais ferramentas (IDEs) para trabalhar com a linguagemVariáveis, constantes e stringsOperações matemáticasOperadores lógicos, relacionais e condicionaisEstruturas de repetição (comandos for e while)Criação de funçõesListas, dicionários, tuplas, conjuntos e matrizesManipulação de arquivos de textoTratamento de erros e exceçõesExpressões regularesBásico sobre Orientação a ObjetosApós aprender os conceitos básicos da linguagem, você poderá aplicar os conceitos em exercícios, desafios e projetos práticos relacionados a área da Biologia. Veja abaixo alguns dos estudos de caso que implementaremos passo a passo:Previsão de massa de uma sequência peptídica de acordo com sua composição de aminoácidosProgramar uma prova de biologia que calcula a nota e se o usuário acertou ou errou cada perguntaCriação de classes relacionadas a objetos do mundo biológicoAnálise de sequências gênicas.fastaAnálise de frequências gênicas de acordo com o Teorema de Hardy-WeinbergCriação de funções para cálculos de ecologia populacionalDescobrir padrões em sequências de RNACálculo de estimativa de distâncias gênicasChave de identificação de espécies básicaResolução de problemas de frequências gênicasCriação de scripts que analisam arquivos de sequências de proteína do tipo.pdbTranscrição de sequências de DNA em RNASão mais de 90 aulas, dentre conceitos, demonstração de códigos para entender os conceitos e resolução de exercícios. Mais de 30 desafios propostos aplicando os conceitos aprendidos em cada seção em um contexto biológico, com vídeos de resolução passo-a-passo de cada desafio. Também desenvolveremos 4 pequenos projetos nos quais serão propostos alguns desafios mais complexos e que exigem a utilização da maioria dos conceitos visto até o momento da proposição desses desafios
